フォントサイズが同じ設定なのに、シートや帳票定義ごとに大きさが異なる

それぞれのシートや帳票定義でページサイズが異なっていないかご確認ください。

ConMas Managerで、「帳票定義」タブで該当の帳票定義を開き、
画面左側ツリーの「基本情報」配下のシート名を開き、画面右側に表示される
プレビュー画面右上の「・が縦に3つ並んだアイコン」-「ドキュメントプロパティ」で
「ページサイズ」の項目から各シートのページサイズが確認できます。

大きな紙と小さな紙に同じサイズの文字を乗せた場合に見え方が異なるように、
シートのページサイズが異なっていた場合、文字サイズを同じ値に設定していても
i-Reporterアプリ上で入力された文字のサイズが異なっているように見えてしまいます。

帳票上で見えるフォントの大きさを揃えるには前述のページサイズを揃えることで可能です。

なおページサイズはConMas Designerで取り込みを行うExcelファイルの印刷設定から確認できる用紙サイズに比例しますので、各シートや帳票定義で用紙サイズを揃えてください。