i-Repo Linkでkintoneのレコード登録時に入力帳票をファイルとして添付することはできますか？

可能です。

i-Repo Linkの「業務システム連携」-「kintone」-「入力結果の登録」で対象のマッピングを開き、「ファイルマッピング」にてファイル形式を設定して保存してください。

kintoneアプリ側では対象のkintoneアプリで「歯車アイコン」-「フォーム」にて添付ファイルを設定してください。