同じ帳票を何度も保存した場合、自動出力されるCSVは上書きになりますか

出力先ディレクトリ、ファイル名が同じになる場合は上書きとなります。

別ファイルとして保存したい場合は、秒数まで含めたファイル名を設定するなど、ファイル名が異なるように設定してください。